虽然两个都是作为填充的材料，但是两者还是有区别的。
1、来源不同。
玻尿酸是一种生物制品，来源广泛容易得到。自体脂肪则是从自身脂肪堆积比较多的部位来进行提取，并且需要进行提纯、净化处理之后才能使用。
2、功能不同。
玻尿酸可以祛除静态皱纹（嘴角纹、法令纹等），同时还可以填充面部凹陷（额头、太阳穴、泪沟、苹果肌、面颊），装饰面部（丰唇、隆鼻、丰下巴、丰耳垂）。
自体脂肪移植可以填充面部凹陷(额头、太阳穴、泪沟、苹果肌、面颊)，装饰面部(丰唇、丰下巴)及重塑身材(隆胸、丰臀)等。并且它不仅有填充作用，还可以改善肤质，弹性纤维，胶原蛋白。
3、维持时间不同
玻尿酸因为会被人体吸收，因此并不能长久维持，根据剂量及分子大小区别，能维持3-12个月不等。
自体脂肪只要存活之后，效果是能一直维持的，但自体脂肪存在存活率问题。
4、恢复时间不同
自体脂肪恢复期会比玻尿酸恢复期更长一些。
不管使用哪种方式都需要通过正规医院进行操作，才能避免术后后遗症产生。
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